Как известно, ситуация с футбольными клубами в российских городах такова, что их статус может меняться не только по спортивному принципу.
Поэтому понятие "клуб РФПЛ" (высшей лиги в России нет уже лет как 17) будем использовать по состоянию на 28 июня 2018 года.
Теперь дальше. Городов, где проходят матчи чемпионата, 11. Стадионов 12.
Москва: ("Лужники", "Спартак")-клубы РФПЛ: ЦСКА, "Спартак", "Локомотив", "Динамо".
С-Петербург:("С-Пете<wbr />рбург-арена") - клуб РФПЛ "Зенит".
Волгоград: ("Волгоград-арена") - клуб ФНЛ "Ротор".
Екатеринбург: ("Екатеринбург-арена<wbr />") - клуб РФПЛ "Урал".
Казань: ("Казань-арена") - клуб РФПЛ "Рубин".
Калининград: ("Калининград") - клуб ФНЛ "Балтика".
Нижний Новгород:("Н.Новгоро<wbr />д") - клуб ФНЛ "Олимпиец".
Ростов-на-Дону: ("Ростов-арена") - клуб РФПЛ "Ростов".
Самара: ("Самара-арена") - клуб РФПЛ "Крылья Советов".
Саранск: ("Мордовия-арена") - клуб ФНЛ "Мордовия".
Сочи: ("Фишт") - нет клуба.
Таким образом клубов РФПЛ нет в Волгограде, Калининграде, Нижнем Новгороде, Саранске и Сочи.
Остальные проблемы, затронутые в Вашем вопросе в компетенции региональных и местных властей, а так же министерства спорта и руководства российского футбола.