В чемодане был героин. Я так думаю. Ну или деньги.
Это был чемодан их босса, Марселласа Уоллеса. Чемодан они забрали у Бреда и его компаньонов, застрелили их, но одного беднягу забрали с собой. В машине Винстон случайно "размазал" его мозги по салону, нелепая случайность.
Чемодан, вернее действие вокруг него, само "размазано" по фильму, снятому по частям не в хронологическом порядке.
На картинке сцена из финальной части. Джулс показывает содержимое чемодана грабителю-неудачнику Ринго.
По концовке видно, что чемодан всё-таки будет доставлен Марселласу. Однако Джулс решил "завязать" и стать странствующим проповедником. Винсент недоумевает, но уходят они из кафешки, в которой всё началось и закончилось, всё-таки вместе.
Версия о том, что в чемодане типа "душа Марселласа", потому что код на чемодане "666", мне кажется нелогичной, хотя многие критики в этом уверены. Сто раз наверное смотрел, а на эти цифры внимания никогда не обращал. Естесственно, и ассоциайций "шестёрок" с "душой" тоже возникнуть не могло.
Спасибо, что напомнили! Очень хороший фильм. Сейчас ещё раз пересмотрю.