Да, можно сажать разные по цвету петунии в один горшок. Если вы намереваетесь собирать семена на следующий год, то цвета будут не такие, как в исходных цветках, они переопылятся. Я сажала вместе сиреневые и белые петунии (правда, не в горшке, на клумбе), на следующий год выросли цветки разных оттенков сиреневого, белых не было. Если вы семена собирать не будете, то неважно, разные цветки в горшке или одинаковые.
По поводу того, сколько цветков в горшке, это зависит от размера горшка, плодородности грунта, наличие или отсутствия подкормки, полива, освещения.
Вообще, у тех петуний, которые я сажала, всхожесть была не очень (первый год у меня вообще ничего не выросло) так что я посеяла много, а потом лишнее пересадила в другие места. Петуния пересадку нормально воспринимает.