Если взять неполадки вызванные именно по вине пользователя, то их не так много.
1 - пыль. Далеко не все знают, что чистить компьютер необходимо так же, как и убирать в квартире. Частота таких генеральных уборок в каждом случае разная, и зависит от запыленности помещения, но в среднем привык чистить его раз в пол года. Благо, имею большой опыт в разборке компьютеров и ноутбуков, иначе приходилось бы носить в сервисный центр.
2 - удары, вибрации очень пагубно влияют на жесткий диск и качество контакта соединений.
3 - не правильный подбор комплектующих. На первый взгляд эта проблема может быть и не заметна, но дисбаланс в системе внесенный всего одним устройством может приводить к повышенному износу остальных комплектующих.
Очень редко, но случаются повреждения из за разгона системы, поврждения соединительных шнуров, выламанные USB порты, испорченные (физически, например попал инородный предмет)dvd приводы.
Вроде ничего не забыл...