Все зависит от причины опоздания. Если это уважительная причина, например, авиакомпания отменила рейс, три дня была нелетная погода или наводнение затопило единственную дорогу и выехать не удавалось, то ничего не будет. Начальники поворчат и успокоятся. В часть обязательно нужно позвонить или телеграфировать о причине опоздания. Лучше послать телеграмму, заверенную администрацией аэропорта, или местной МЧС, или своего села. Это уже для командира части документ, обязывающий его, не возбуждать уголовного дела, да и просто не наказывать. А вот если уважительных причин не было и опоздание было более чем на два дня, оргвыводы могут быть серьезные. Там уже зависит от двух дней до десяти или от десяти и до месяца, ну и более месяца.
Так вот в любом случае свыше двух дней уже серьезное наказание, А свыше 10 дней очень серьезное. Ну и более месяца это уже тюрьма. Много зависит от командования части. Иногда командир собирается в академию и ему сор из избы выносить себе дороже. Бывает, пытаются это дело замять. Но это не часто. Сейчас вполне могут посадить и лучше не рисковать.
Срочнику особо ничего не будет, если опоздал на несколько дней, но если он захочет стать контрактником, скорее всего у него ничего не получится. Таких недисциплинированных в армии не любят и личное дело испортят такому "военному" обязательно, чтобы потом ни в полицию, ни в МЧС ни в прочие серьезные структуры его не брали.
Контрактника могут наказать куда серьезней. Это и лишение премиальных и понижение в должности и куча других мелких неприятностей, которые скажутся на его дальнейшей службе. Ну и скорее всего с таким контрактником продлевать контракт уже не будут. Повторяю, это опоздание до двух дней, ну могут "зажмуриться" еще на один два дня, не более. А потом начнутся репрессии к таким нерадивым воинам. Иногда даже серьезнее, чем они могут рассчитывать. Если воин и до этого служил плохо с взысканиями и неприятностями на службе, то тут его "прокрутят" по полной. Ну, и наоборот. Если человек отлично служил и не было никаких нареканий, то могут многое простить. Человеческий фактор никто не отменял.