Пустая фраза.
Просто в определенный период жизни, ближе к завершению, человек остается с тем раскладом сил и возможностей, который образовался к этому моменту. И тут уж ничего не остается, как "формально" закрепить сложившееся положение вещей этой расхожей фразой.
А если вдуматься в нее?
Разве всё и так не располагается на "своих местах"? То есть на тех позициях, которые никто (ничто) другое не занимает. И поэтому считается "своим". В этом смысле фраза бессмысленна (тавтология, знаю). То же самое, как сказать, например: "Я живу в своей квартире". А в чьей-же еще квартире может жить человек (в нормальной ситуации, конечно)? Только в своей, не в чужой.
Второе замечание поглубже. Многие ли знают точно "свое место"? Я вот наблюдала немало людей, которые до конца жизни проживали что-то чужое, не свое. В молодости у них не было понимания, воли, решимости выбрать только собственную дорогу жизни. Многие поддавались давлению родителей, сверстников, толпы. А потом, повзрослев, обнаруживали, что учатся и работают в сферах, к которым душа не лежит. Менять поздно или опять нет воли - семья, долги и проч. Вот человек и проживает, не реализовав заложенные способности. Разве можно сказать про такого, что время для него "расставило всё по своим местам"? Ровно наоборот - время увело его от "своего места".
Ну для тех, кому все равно где учиться-работать, любое место будет "своим".