Да. Крымчане, которые живут и работают в России, для получения российского паспорта могут обратиться в ближайшее Управление Федеральной миграционной службы по месту фактического нахождения. Это может быть и Москва, и Санкт-Петербург, и Мурманск, и Владивосток, и Самара... В общем любой город Российской Федерации.
Единственный момент отличный от получения паспорта в Крыму - это госпошлина 200 рублей и оформление чуть дольше, потому что будет делаться запрос в Крым по месту постоянной прописки. Если нет у обратившегося гражданина на руках нет национального украинского паспорта, можно обратиться, имея на руках заграничный паспорт. На сайте ФМС есть запись брифинга, в котором подробно обсуждается этот вопрос.
Список документов, необходимых для получения российского паспорта:
Если крымчанин, находящийся в данный момент на территории России вне Крыма, не хочет получать российский паспорт, он должен до 18 апреля 2014 года официально известить об этом ФМС.