Ха. Столкнуться они могут с чем угодно, вплоть до банального голода и жажды и даже удушения от недостатка воздуха, если не создадут соответствующей инфраструктуры по возобновлению ресурсов - кислорода, воды, пищи. Ясен пень, что рассчитывать на поставки с Земли тут не приходится, это вам не МКС, у которой Земля под боком.
Вторая очевидная проблема - радиация. У Марса практически отсутствует магнитное поле и довольно тонкая атмосфера, поэтому уровень космической радиации на его поверхности на порядок превышает земной. А на пиках солнечной активности превышение может быть и на два порядка.
Это же - тонкая атмосфера - делает актуальной и проблему метеоритов, от которых она практически не защищает. А учитывая, чт Марс гораздо ближе к поясу астероидов, чем Земля, эта опасность там реальна.
Это же делает для будущих марсиан невозможными прогулки без скафандра, что тоже не добавляет комфорта.
g: ускорение свободного падения там чуть не втрое меньше земного, и как длительное - годами! - пребывание людей в условиях пониженной гравитации скажется на их здоровье, одному богу известно. Хотя с другой стороны, низкая гравитация упрощает строительные работы.
Энергетика: уровень солнечной облучённости поверхности Марса в 2,5 раза ниже, чем на Земле, так что солнечные панели будут во столько же раз менее эффективны. К тому же частые песчаные бури и высокая абразивность марсианского песка снижают эффективный срок службы солнечных батарей (поэтому оптимальным источником энергии был бы компатный ядерный реактор - такие уже есть, просто применяются не там, где они были бы полезны).
Температуры окружающей среды. По той же причине - удалённость от Солнца - Марс представляет собой довольно суровое место. Более-менее путные условия там разве что на экваторе, даже бывает сравнительно тёпло, до +20. Но в остальных районых там собачий холод, примерно арктический.
Минеральные ресурсы: для того, чтоб развиваться, колонии потребуются стройматериалы, которые надо опять же искать на месте, а не таскать с Земли, так что потребуется пропасть времени и сил на геологическую разведку, а затем и на создание соответствующей промышленности по добыче и переработке. И по изготовлению всего чего нужно.
Биологническая опасность: на данный момент это больше умозрительный фактор. Но если на Марсе будет обнаружена примитивная жизнь (вирусы, бактерии...), то проблема станет серьёзной, потому как у земных организмов - человеческих, например, - может не оказаться защитных механизмов, способных противостоять инопланетным микробам.