У некоторых представителей (напр. у Phyllocladus) развиваются листовидно сплюснутые побеги - филлокладии. Цветки мелкие, однополые (растения одно и двудомные), без околоцветника, но иногда с прицветниками. Мужские цветки либо одиночные, либо парные, либо собранные пучками, комками или метелками. Цветок состоит из оси и различного числа (иногда до сотни) чешуйчатых или более или менее щитковидных тычинок, расположенных по оси спирально или мутовчато. На нижней стороне тычинки помещается различное число (два у еловых, три-пять у кипарисовых и тисовых, или много у араукарий) одногнездных, шаровидных, продольных или мешетчатых пыльников, вскрывающихся обычно продольною трещиною. Пыльца порошковатые (опыление ветровое); у некоторых представителей (у сосны) наружная оболочка пыльцевого зернышка вздувается, образуя по бокам зерна два пузыревидных выроста, наполненных воздухом. После высеивания пыльцы, мужские цветки увядают и сваливаются. Женский цветок необычайно простого строения: он состоит из одной лишь семяпочки, помещающейся либо на верхушке ветвей (напр. у тиса), либо (по одной, по две или по несколько) в пазухе кроющих листьев, сгруппированных в соцветия, так назыв. "шишки". Обыкновенно в шишковидном соцветии наружный покров семяпочки развивается либо в мясистое тело, окружающее валиком семяпочку, в так назыв. кровельку, либо в пластинчатое тело, так назыв. "семянную чешую", более или менее плотно срастающуюся с кроющим листом в так назыв. "шишковую чешую".
