Сочетание слов:
– является, так называемым, наречным выражением, и чаще всего в предложении выступает обстоятельством образа действия, отвечающим на вопрос «как?» или «когда?» и запятыми не обособляется. Его можно заменить близкими по смыслу сочетаниями слов: «в результате», «в итоге». То есть оно несет в себе значение конечной цели, завершения.
Например, в таком предложении:
Мне кажется, что ты в конечном итоге забудешь это недоразумение, и мы останемся друзьями.
Но иногда (значительно реже) это сочетание используется, как вводная конструкция, которая имеет значение, близкое словам «в конце концов», «если разобраться», «если подумать». В этом случае запятыми выделяется.
Приведем пример:
И я уже, в конечном итоге, понимаю, что ничего хорошего из этого не получится.