1) Существует три вида подчинительной связи: согласование, управление, примыкание.
Пример: В темном небе ярко блеснула молния. Блеснула (где?) в небе, это связь управления, глагол (главное слово) задает существительному предложный падеж, в управлении также участвует предлог.
В небе (каком) тёмном - это связь согласования в ср.роде, ед. числе и П.п. Средний род - постоянный признак существительного, а падеж и число определяются в данном предложении. Существительное - главное слово, а прилагательное - зависимое слово.
Блеснула (как?) ярко, это примыкание. Глагол - главное слово, наречие - зависимое слово.
Связь согласование и управления выражается с помощью окончаний, в то время как примыкание определяется по смыслу и по позиции слова в предложении.
2) Трудности возникают для связи управления, причем существуют специальные словари на эту тему. Управлять падежом могут не только глаголы, но и существительные и прилагательные (сказка о добре и зле, бледный от страха). Но в каждом случае выбирается определенный падеж, при этом их может быть несколько, также возможны варианты и ошибки при выборе падежа.
Например, рассмотрим существительное "договор", которое может управлять 3-мя разными падежами с разными предлогами: договор на строительство (В.п.), договор о поставке материалов (П.п.), договор купли-продажи (Р.п.) без предлога.