Да, были. Во-первых, неизвестно точно, кто отец Павла I - Петр III или Сергей Салтыков.
Что касается остальных:
Анна Петровна, отцом которой является Станислав Понятовский;
Алексей Григорьевич Бобринский, сын от Григория Орлова;
Елизавета Григорьевна Тёмкина, дочь Григория Потёмкина.
Если верить слухам, то у императрицы было еще несколько внебрачных детей:
Александра Васильевна Браницкая, дочь Василия Андреевича Энгельгардта;
Наталия Александровна Алексеева, графиня Буксгевден, дочь Григория Орлова;
Елизавета Александровна Алексеева, дочь Григория Орлова.
Дети Екатерины II - очень спорный и запутанный вопрос, ответить на который затруднялись даже члены царской семьи.