Оба слова - эфир и этил (а также их производные, например, "этан", "этерификация", "этилен" и др.) в русском языке произошли в конечном счете от греческого слова αἰθήρ, которое у греков означало некую летучую небесную субстанцию, которая пронизывает космос (примерно в таком же смысле понятие "мирового эфира" возродилось в физике конца XIX века). А ведь эфир очень летуч, как бы "улетает в небо" :). Произношение греч. теты (θ) напоминает произношение th в английском языке, откуда и английское название ether - простой эфир (раньше писали через дифтонг - æther, следуя греческому языку), и многие другие термины в западноевропейских языках: англ. thermodynamics, итал. thermos, франц. thermomètre, немец. Thermochemie и т.д. В русский алфавит греч. "тета" перешла когда-то в "фиту" (с тем же начертанием), которая со временем превратилась в букву "ф". Но когда-то писали и Θедоръ, и Федор, и "θеатръ", и "театръ". В русской химической номенклатуре с XIX века буква "ф" оказалась только в слове "эфир". А буква "т" - в словах "этан", "этанол", "этил" (в том числе и этиловый спирт), этерификация. При этом для непрофессионалов может возникнуть путаница со словом "эфир", потому что эфиры бывают простыми (например, известный диэтиловый, от же серный, эфир С2Н5-О-С2Н5) и сложными (например, этиловый эфир уксусной кислоты СН3СООС2Н5, он же этилацетат, распространенный растворитель). В западноевропейских языках путаницы нет, потому что, например, по-английски простой эфир - ether, а сложный ester. (И хотя в русском языке есть только одно слово - эфир, но нет слова "эстер" (разве только в виде женского имени Эстер), появилось "новообразование" - "полиэстер", то есть полимер сложного эфира, хотя в энциклопедиях и учебниках такого слова нет - только "полиэфир", "полиэфирные волокна".) С другой стороны, буква "т" появилась в слове "этерификация", означающего реакцию образования сложного эфира! По логике должно быть "эфирификация", но такое слово русским химикам XIX века, наверное, показалось очень неуклюжим, так что они писали "этерификация". Но путаница с буквами тогда тоже была. Например, у Бгокгауза в 81-м томе можно найти и "сѣрный эфиръ", и "сѣрный эθиръ". В новой украинской химической номенклатуре путаницы нет: простой эфир — етер, сложный эфир — естер. Происхождение же слова ester в европейских языках другое: это слово искусственное, его придумал в 1848 году известный немецкий химик Леопольд Гмелин. По-немецки уксус - Essig, эфир - Äther, этилацетат (раньше его называли уксусноэтиловым эфиром) - Essigäther. Из этого слова, взяв некоторые его буквы, Гмелин и придумал название для сложных эфиров - Ester. Видимо, чтобы их не путали с простыми эфирами.