Торговый оборот между Россией и Японией довольно скромный по современным меркам. Он занимает всего от 0,6% до 2,3% внешнего общего торгового оборота Японии. Своего максимума, торговый оборот между Японией и Россией достиг в 2014 году и составил 31 миллиард долларов США. Доля Японии во внешнеторговом обороте России в 2019 году составила 3,0475%. Доля Японии в экспорте России в 2019 году составила 2,6853%. Доля Японии в импорте России в 2019 году составила 3,6756%.
В том же 2014 году, Япония присоединилась к антироссийским санкциям. Торговый оборот между Японией и Россией сократился в десять раз.
Россия закупает в Японии легковые и грузовые автомобили, экскаваторы, медикаменты, нефтеперерабатывающи<wbr />е оборудование. Для России в Японии было построено два океанских контейнеровоза и два океанских нефтеналивных танкера. Так же Россия закупает в Японии кофе, чай, какао, каучук, кондитерские изделия из сахара, алкогольные и безалкогольные напитки, морепродукты, минеральные масла, парфюмерию, краски и лаки, поверхностно-активные органические вещества, клеи, ферменты, бумагу, картон и пластмасс, химические нити и химические волокна, автомобильное и техническое стекло, природный жемчуг, алюминий и изделия из него, оборудование и механические устройства для ядерных реакторов, медицинские и хирургические принадлежности.
Экспорт России в Японию в 2019 году составил 11 353 033 488 долларов. Импорт России из Японии в 2019 году составил 8 960 307 304 долларов США. Сальдо торгового баланса России с Японией в 2019 году сложилось положительное в размере 2 392 726 184 долларов США.
Россия поставляет в Японию уголь, древесину, нефть, битум, никель, черные металлы, алюминий, серу, мебель, рыбу и ракообразных, овощи и фрукты, пшеницу и ячмень, лекарственные растения, жир и масло животного происхождения, мясопродукты, соль, алкогольные и табачные изделия, уксус, минеральные удобрения, эфирные масла, целюлозу, макулатуру, картон, трикотажную одежду, обувь, драгоценные камни и ювелирные изделия, маломерные суда и плавучие конструкции.