Обычно я сталкивалась с менее крупными вредителями моркови, которые не съедают морковь так откровенно, например с личинками морковной листоблошки, которые выгрызают в моркови неправильные ходы. Но если морковь съедена подчистую, то это несомненно какой-то грызун. Скорее всего, судя по масштабу повреждений, это работа слыпыша, животного, которое проделывает под землей многочисленные ходы, найти выходы которых на поверхность можно только по холмикам земли. Этот слепыш есть исключительно подземные части растений, причем не брезгует ничем - морковь, свекла, луковицы цветов, корни. Примерно также вредит и крот, но того сразу заметно по его большим выгребным кучам.
Иногда на огороде могут завестись хомяки, земляные или водяные крысы, полевки, но эти грызуны повреждают и верхнюю часть растений.
Ловят слепышей и других грызунов специальными мышеловками, отпугивают ультразвуком и подкладывают у нор яды.