Официально Ватикан никого не поддерживал во время Второй мировой войны, а фактически оказывал помощь евреям.
Весной 1939 года Святой престол возглавил Римский Папа Пий XII (итальянец Эудженио Пачелли), а осенью того же года началась война. До понтификата будущий Папа Римский почти 20 лет прожил в Германии: сначала нунцием (послом) Святого престола, затем в сане кардинала. О ситуации в нацистской Германии знал не понаслышке. Его предшественник Пий XI в 1933 году заключил конкордат (договор) о свободе церкви с пришедшими к власти национал-социалистами. Несмотря на подписанный конкордат, нацисты начали нарушать договор и всячески преследовать католические организации. В 1937 году Пий XI опубликовал официальный документ - энциклику "Mit brennender Sorge",- осуждающий нацизм и расовую идеологию нацистской Германии. Текст написал кардинал Пачели (будущий Пий XII). Вопреки сложившейся традиции, энциклика была написана не на латыни, а на немецком языке, отпечатана в типографиях и распространена во всех католических приходах Германии. В марте 1937 года послание Папы Римского было прочитано во всех католических храмах Германии. Нацисты быстро отреагировали на осуждение своего режима: все немецкие типографии, напечатавшие энциклику, были закрыты, а владельцы и работники арестованы.
В 1942 году во время оккупации Нидерландов Католическая церковь выразила протест против гонения евреев. В результате, местное гестапо, помимо евреев-иудеев, отправило в концлагеря 4 тысячи крещеных евреев-христиан.
Имея такой печальный опыт, Папа Римский Пий XII, невзирая на давление извне, предпочел придерживаться позиции официального невмешательстве в мировую политику, чтобы не навредить тем, кого преследовали фашисты.
Между тем при официальном нейтралитете Ватикан, находясь в самом центре фашистского Рима, оказывал помощь и поддержку евреям, укрывая их в монастырях и на территории самого Ватикана, выдавая фальшивые документы.
Сразу после войны спасенные Ватиканом евреи выразили Папе Пию XII благодарность. Еврейский историк и дипломат Эмилио Пинхас Лапид писал, что Пий XII, Святой Престол и вся Католическая Церковь за время Второй мировой войны спасли от смерти около 850 000 евреев.