Для гидроизоляции фундамента используют прокладку из толя типа ТГ-350. Но думаю такая прокладка не очень хорошая, так как при этом отсутствует прямой контакт (адгезия) стен строения с фундаментом. И при возникновении механических колебаний, например того же землетрясения, строение может поехать по этому гидроизоляционному покрытию и развалиться. Поэтому лучше использовать стяжку из бетона с хорошим добавлением жидкого стекла. Именно жидкое стекло и является гидроизолятором. Но при этом сохраняется контакт стен с фундаментом и строение будет более прочно опираться на фундамент. Боковые внешние стенки фундамента, если он имеет подземную часть, обрабатывают раствором битума. После застывания засыпают землей.
Я понимаю суть вопроса не в охране строения, а лишь в защите от разрушения постройки на период консервации. Иногда это мера вынужденная, например: дом, построенный из влажного бревна или бруса должен пройти естественную просушку и полную усадку. Законсервированное строение должно быть полностью защищено от воздействия атмосферных осадков. В случае с бревенчатым домом, когда до усадки нельзя возводить капитальную кровлю - устраивается временная из недорогих материалов. Второй важный момент: все коммуникации к дому должны быть отключены на период остановки строительства. Вопрос с охраной - это уже не строительная тема, и решается на усмотрение застройщика.
Лучший вариант - это скала. Причём пишу серьёзно. Менее лучший - это глина или суглинок.
Ну а если вокруг чернозём, рядом река, которая каждую весну разливается и всё вокруг топит(как в Приморье река Сучан, например), то закручиваем длинные винтовые сваи(если дом из дерева), а под блоки или кирпич предварительно выбираем место по выше.
Вообще люди строят везде, включая болото, пустыню или просто воду. Но тогда нужны спец.технологии, благодаря которым и можно осуществить такое строительство.
Рекомендую считать на специальном калькуляторе. Я лично только что для себя так считала, сколько блоков мне понадобится. Считала здесь. При высоте в 3 метра на стены уйдет при кладке в пол блока 50 кубов, то есть 3586 блоков. Это при стандартном размере 39 на 19 на 19. Считала без окон и дверей, с ними уйдет, конечно же, меньше.
Построить реально. Типовый проект, отработанные технологии, подобранный штат рабочих, наработанные поставщики, и, ну может не за 4 месяца, но за один строительный сезон вполне можно сдать коттедж под ключ. НО - это дом на продажу. Если строить для себя, то Вы абсолютно правы - заложил фундамент - дай ему остстояться, выгнал первый этаж - еще пусть постоит, потом второй уже погодя строить.