Сочетание в порядке может употребляться в нашей речи как предложно-падежная форма существительного порядок.
Например. Надо бы содержать в порядке свое рабочее место, и документация рабочая должна быть в порядке полном.
Предлоги с существительными пишутся раздельно (как и с другими частями речи).
Это же сочетание может быть и предлогом.
Например. Врач принимал пациентов в порядке живой очереди.
Здесь в порядке -- тоже сочетание предлога и существительного, но образующее новый предлог, производный,
который требует родительного падежа.
Так как существительное порядок сохраняет в определенных значениях падежные формы (на порядок больше, порядком надоело), то сочетания его с различными предлогами, имеющие наречное значение, пишутся раздельно.
Так что в любом значении (предложно-падежной формы или наречном) это сочетании пишется раздельно.
Просто нужно различать при разборе предложения эти сочетания, понять смысл сказанного.