Любое вмешательство (а тем более медицинское) сопровождается какой - либо реакцией со стороны самого организма. Как уже отметили выше, реакция эта может быть общей (это общая слабость, гипертермия, тошнота и тд, которые обусловлены системным действием на организм/тело) и местной (гиперемия, боль, зуд/жжение, отек и тд).
Именно таким местной реакцией на раздражитель (а вакцина от дифтерии - АКДС или АДС это живые, но ослабленные микроорганизмы, вводимые для выработки соответствующих антител и, как следствие, стойкого иммунитета) и является эта шишка.
Опасности в такой реакции нет, со временем (несколько суток) она должна пройти самостоятельно.
Если шишка так и не проходит, а тем более присоединилась и сохраняется болезненность, то стоит посетить своего участкового врача.